県内主要都市との位置関係は、一般的な交通手段を用いた場合、県庁所在地の
長野市から南方へ約100kmである。交通手段としては、
中央自動車道、
JR東日本中央本線が市内をほぼ南北に通る。
東京からのアクセスは2時間強、また、中央自動車道経由で
名古屋からも2時間程度でアクセスでき、これらの都市圏からの交通の便が比較的良い。
諏訪盆地には、
峠を挟んで諏訪側が反対側に比べて急勾配である、という地形が見られるが、諏訪市も例外ではなく、同様の地形が、例えば諏訪市と
上伊那郡辰野町を結ぶ
県道50号(
有賀峠)などに見られる。これは、諏訪地方に
中央構造線と
糸魚川静岡構造線が通ることに起因する
断層地形である。なお、この2つの構造線は諏訪市付近で交差(接触)しているとされている。東側の山地のふもとは、いくつかの小さな
扇状地を成しており、ここには住宅や田畑等が広がっている。
市内平地を見てみると、諏訪湖へ向かう幾本かの河川の間に
田畑、
住宅地が広がっている。赤沼(あかぬま)、中洲(なかす)といった地名が表すように、古くは
沼だったり、もしくは諏訪湖が最大面積であったときに水中だった場所も多く、
地盤は全体的にゆるい。そのためか、
地震が観測されるときも、長野県の近隣地域に比べ震度が大きくなることが多い。このような点から、
東海地震想定
震度は最大で6弱となっており、非常に大きな揺れが懸念され、
地震防災対策強化地域となっている。